日本16日就渔船被扣和渔民死亡事件向俄驻日本大使馆表示抗议。日本外务大臣麻生太郎１６日召见俄罗斯驻日临时代办，要求俄方马上归还死者遗体和船员船只，并作出赔偿。俄方则称“日本渔船侵犯了俄罗斯领海，是一种危险行动”。

　　北方四岛（南千岛群岛）问题是日俄最敏感的领土争端问题之一，这起事件对解决这一问题的前景进一步蒙上了阴影。

　　北海道根室市市长藤原弘１６日举行新闻发布会说，根室市准备向日本政府提出，中止本年度与北方四岛的无签证交流和人道支援。

　　无签证交流由原苏联总统戈尔巴乔夫提议，旨在加强日俄两国居民交流，为早日解决领土问题提供条件。

　　《朝日新闻》中，这是１９９２年开始实施无签证交流以来，日方首次提出中止要求。