据台湾媒体报道，为了得到美国更大的支持，2001年4月份在陈水扁的指示下，台湾军购代表团赴美会见美国国防部官员。会后，美国政府宣布同意向台湾出售三项武器。这是最近二十多年来美国最大的一笔对台军售。

　　2004年6月份，台湾当局行政部门通过了“特别军购案”，共编列6108亿新台币，约合182亿美元。该案规定从2005年开始，在15年之内向美国购买12架P3C反潜机，6枚爱国者三型导弹，以及8艘柴油动力潜艇。

　　台湾当局主导的“特别军购案”一直遭到国民党和亲民党等党派、团体和民众的反对。为了争取在台湾立法机构通过这项军购案，台湾当局行政部门曾经做出多次修改，将特别预算的总金额由6108亿元新台币下调到目前的3400亿元。尽管如此，台湾民众平均每人仍然要为此负担将近15000元新台币。