对于陈水扁大幅度更换当局高层官员任命，台湾各党派人士对此有不同解读，有民进党人士认为陈水扁这是要为陈唐山下一步任台湾行政部门负责人做准备，国民党人士则认为，陈水扁的做法都是在为2008年的台湾地区领导人选举布局。

　　2月6日，民进党民意代表黄伟哲在接受台湾媒体电话访问中说，他认为将陈唐山调任台湾安全部门秘书长是陈水扁为2008年选举做准备，如果民进党内确定苏贞昌和谢长廷参选，那么陈唐山将成为台湾行政部门负责人。

　　国民党籍民意代表洪秀柱说，把邱义仁放到陈水扁办公室，可能是为陈水扁自己的后路着想，要找一个人保护他。至于陈唐山，陈水扁也许就是想通过他跟美国方面的一些关系为自己今后做个安排，不管怎么样，陈水扁是为他自己着想。                    均据央视《海峡两岸》