2003—04赛季，当时弗朗西斯和姚明领衔的火箭队以45胜37负的常规赛战绩闯进了季后赛，姚明在自己的二年级交上了场均17.5分9个篮板球的常规赛数据。但显然当时姚明的心态没有调整好，在季后赛的5场比赛中没能发挥出自己的最佳状态，场均得到15分和7.4个篮板。

　　2004—05赛季，在常规赛中球队结束了磨合期之后，后发制人的火箭取得了西南赛区的第三名，以51胜31负的战绩挺进季后赛。姚明在那个赛季有了稳步的提高，常规赛中已经能场均送出18.3分和8.4个篮板球。在季后赛中，面对着实力强劲的小牛，火箭队打出了近几个赛季中最顽强的系列赛。姚明场均贡献21.4分和7.7个篮板和2.7次盖帽。

　　2006—2007赛季，火箭队打出了最近10个赛季以来的最好战绩，姚明本赛季共出战48场，场均上场33.47分钟，得到25.0分9.4个篮板2.0次助攻2.0次盖帽，犯规3.3次，失误3.5次，拿下火箭队“得分王”、“篮板王”和“盖帽王”三项殊荣。但在季后赛上姚明交出了一份毁誉参半的答卷。