陈水扁下台前夕，台湾当局爆出“金援外交”重大弊案：原打算用于达成与巴布亚新几内亚“建交”的近3000万美元“金援”疑遭中间人侵吞，台行政当局副负责人邱义仁、对外事务主管部门负责人黄志芳和防务部门副负责人柯承亨等多名陈水扁亲信涉案。

　　这一事件发生于2006年，时任台“国安会秘书长”的邱义仁交给黄志芳一件与巴布亚新几内亚“建交”的“秘密外交案”，并将中间人金纪玖介绍给黄志芳认识。

　　当年9月14日，台对外事务主管部门将2980万美元汇到中间人金纪玖、吴思材在新加坡某银行的联名账户。其后，巴方表态无法与台湾“建交”。黄志芳随即向邱义仁报告，表示要追回款项。但后来金纪玖失踪，追讨款项事宜也毫无进展。

　　案件于今年４月底曝光后，台湾检方先后传唤了邱义仁、黄志芳、柯承亨并搜查了他们的住处和办公场所，三人随后宣布辞职；吴思材遭拘押，另一名在逃的中间人金纪玖被通缉追捕。台北检方取得２张相同的疑似回扣名单，有４名官员和３名民间人士在列，并写明了每人的分配金额和负责事项，但名单内记录的人士均否认收受回扣。目前此案还在进一步侦办中。