跨湖桥文化和上山文化是两个相对独立的文化。考古人员在对浦江上山遗址、嵊州小黄山遗址等上山文化层的发掘中，都在上山文化层之上发现了跨湖桥文化。这让考古人员对这两个文化的关系产生了浓厚的兴趣。

　　在1990年、2001年的两次考古发掘中，萧山跨湖桥出土了大量的陶器、木器和骨器等文物。在2003年的第3次抢救性发掘中，还发现一只距今七八千年的独木舟，并出土了大量的陶器、骨器、木器、石器以及人工栽培水稻等文物。这些出土文物的器型、图案的风貌特征与河姆渡等其他遗址的出土文物有较大的区别，被称为跨湖桥文化。

　　蒋乐平也主持了跨湖桥遗址的发掘，他说，以前一直认为跨湖桥的文化源头应该在海上寻找，现在看来，它的文化源头很有可能在浙中地区。而且，跨湖桥文化与上山文化很可能有某种关系。