了解内情的人士指出，此次调整是陈水扁“绿”化军队、拉拢军方高层，进而延续其政治生命的重要步骤。虽然台军每年1月和7月都要进行人员晋升及职务调整，但从这次调整的情况看，大批“亲扁”、挺“独”将领获得晋升，显然是陈水扁在借机扶植亲“台独”力量，为其全面掌控军队作准备。同时，在两岸关系陷入困境、民进党内讧、蓝营坐大、陈水扁已成跛足之势的情形下，为突破政治困境，在2008年卸任之前留下政治遗产，抓住军队成了陈水扁最后的救命稻草。